Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek8Q91ZR4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek8Q91ZR4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms