Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Pde6cQ91ZQ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde6cQ91ZQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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