Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1bQ91YK2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms