Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd3Q91W18 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms