Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms