Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms