Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fyco1Q8VDC1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms