Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc36Q8VBW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc36Q8VBW8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms