Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms