Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hecw1Q8K4P8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hecw1Q8K4P8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms