Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms