Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms