Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms