Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scara5Q8K299 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms