Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Fcho1Q8K285 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Fcho1Q8K285 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fcho1Q8K285 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fcho1Q8K285 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcho1Q8K285 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms