Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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