Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Nek9Q8K1R7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Nek9Q8K1R7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Nek9Q8K1R7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms