Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700001C19RikQ8K168 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms