Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp1Q8K021 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp1Q8K021 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms