Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp2Q8CGR7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms