Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc43a2Q8CGA3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc43a2Q8CGA3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms