Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms