Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrip1Q8CBD1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrip1Q8CBD1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms