Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Ccdc113Q8C5T8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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