Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp1Q8C4U3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms