Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Iffo1Q8BXL9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms