Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp2Q8BX07 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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