Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtpaQ8BWP5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtpaQ8BWP5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms