Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a4Q8BUE1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms