Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubr7Q8BU04 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms