Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tspan12Q8BKT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspan12Q8BKT6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms