Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps35Q8BJZ4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms