Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdca8Q8BHX3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms