Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Best2Q8BGM5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms