Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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