Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD5

Cpt1c, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1cQ8BGD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms