Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms