Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms