Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms