Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfascQ810U3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfascQ810U3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms