Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Liat1Q810M6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Liat1Q810M6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms