Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim19Q80ZU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms