Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms