Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NischQ80TM9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NischQ80TM9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
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