Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh8Q7TSK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh8Q7TSK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms