Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prrc2bQ7TPM1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrc2bQ7TPM1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms