Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Abcg2Q7TMS5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcg2Q7TMS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcg2Q7TMS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcg2Q7TMS5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Abcg2Q7TMS5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms