Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms