Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynmQ70IV5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynmQ70IV5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms