Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms